近日,中國農業(yè)科學(xué)院植保研究室農作物有害生物防治作用基因組研究自主創(chuàng )新精英團隊在生物學(xué)著(zhù)名刊物《植物生物技術(shù)雜志(Plant Biotechnology Journal)》上發(fā)布名為“Multilayer regulatory landscape during pattern-triggered immunity in rice”的研究分析畢業(yè)論文。該探討根據多個(gè)學(xué)對策,系統軟件分析了稻谷抗病性全過(guò)程中的PTI響應機制,對深層次了解綠色植物抗病性全過(guò)程,及其具體指導稻谷抗病性繁育具備關(guān)鍵實(shí)際意義。
綠色植物演變出了繁雜的自我防御機制來(lái)避免病源真菌和細菌浸染。綠色植物的防護系統包含病源有關(guān)分子結構方式開(kāi)啟的免疫力(PTI)和效用子開(kāi)啟的免疫力(ETI)。在其中,PTI受體的防御力由病源有關(guān)分子結構方式(PAMP)誘發(fā),如細菌來(lái)源于的幾丁質(zhì)(chitin)和病菌來(lái)源于的flg22。這種PAMPs由特殊蛋白激酶鑒別,激話(huà)中下游轉錄因子,誘發(fā)一系列分子結構和生理學(xué)生化反應,通稱(chēng)為病源有關(guān)分子結構方式開(kāi)啟的免疫力(PTI)。目前為止,已經(jīng)有一些報導選用單一或二種組成的組學(xué)對策科學(xué)研究綠色植物的PTI響應機制(包含轉錄組學(xué)、蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)等),但選用多個(gè)學(xué)對策融合科學(xué)研究PTI全過(guò)程的偏少。此外,大部分有關(guān)PTI回應全過(guò)程的組學(xué)剖析都匯集于雙子葉植物擬南芥,科學(xué)研究結果很有可能不適合用以稻谷和別的單子葉植物。
在本分析中,科學(xué)研究工作人員融合了代謝組、轉錄組、蛋白質(zhì)組、泛素化組和乙?;M數據信息,表明了稻谷對真菌和細菌的PAMPs(chitin和flg22)的PTI響應機制。研究發(fā)現chitin開(kāi)啟的PTI反映在轉錄和翻譯水準上與flg22更加類(lèi)似,但在翻譯后裝飾水準和新陳代謝水準上比f(wàn)lg22反映不一樣且更加明顯。在chitin和flg22誘發(fā)的差異性表述遺傳基因中看到了很多防御力有關(guān)遺傳基因,包含編號RLK、MAPK和CDPKs的遺傳基因、轉錄因子、生長(cháng)激素數據信號成份和次級線(xiàn)圈新陳代謝遺傳基因。有意思的是,多個(gè)學(xué)科學(xué)研究揭露了一些重要的生長(cháng)發(fā)育防御力均衡主調整遺傳基因(包含OsALDH2B1、BSRD1、GRF9、HD16、DWARF11、GLW7/SPL13和EBR1等)很有可能在稻谷PTI回應環(huán)節中受體生長(cháng)發(fā)育-抗病性中間的均衡。對稻谷轉錄組和蛋白質(zhì)組的進(jìn)一步融合剖析發(fā)覺(jué),二種PAMP解決的mRNA和蛋白進(jìn)化速率中間存有不一致的狀況。泛素化組學(xué)和乙?;M學(xué)剖析發(fā)覺(jué),蛋白質(zhì)翻譯后裝飾調整很有可能在這樣的差別中起到主導作用。
根據制作類(lèi)化合物和管控轉變圖,系統軟件歸納了PTI全過(guò)程中糖酵解途徑/糖異生、苯丙烷氣生成、黃酮素微生物生成和脂肪酸有關(guān)方式中的多層面管控體制。研究表明,稻谷中的脂肪酸新陳代謝和α-a亞麻酸新陳代謝方式很可能遭受flg22的非特異誘發(fā)。除此之外,與脂質(zhì)、萜類(lèi)(二萜類(lèi)、倍半萜類(lèi)和三萜類(lèi)微生物生成)和維他命(生物素新陳代謝和維生素b2新陳代謝)有關(guān)的方式很有可能也是flg22特異性的PTI反映。該探討根據多個(gè)學(xué)剖析搭建了多層面稻谷PTI回應全過(guò)程管控圖普,為深層次分析稻谷抗病性全過(guò)程中的PTI響應機制給予了主要參照和資源。
中國農業(yè)科學(xué)院植保研究室劉文德研究者和華中農業(yè)大學(xué)綠色植物科技進(jìn)步學(xué)校陳小林副教授職稱(chēng)為文中的一同通訊作者。中國農業(yè)科學(xué)院(深圳市)農牧業(yè)基因組研究所周紹群博士研究生等進(jìn)行了有關(guān)工作中??茖W(xué)研究獲得中國農業(yè)科學(xué)院農牧業(yè)自主創(chuàng )新工程項目的支助。
全文連接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/pbi.13688
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