近日,中國水產(chǎn)科學(xué)院生物科技研究所在鯉抵御嗜水汽單胞菌感柒的分子結構體制領(lǐng)域獲得重大進(jìn)展,有關(guān)探討畢業(yè)論文“Genomic features of common carp that are relevant for resistance against Aeromonas hydrophila infection”發(fā)布于水產(chǎn)品類(lèi)1區雜志期刊《Aquaculture》(2020年JCR1區,IF=4.242)。該畢業(yè)論文獲得我國要點(diǎn)科研開(kāi)發(fā)方案(2018YFD0900102)和中國水產(chǎn)科學(xué)院中央級服務(wù)性科研單位基本上科學(xué)研究業(yè)務(wù)費項目資金(2018B003和2020TD24)支助。江炎亮副研究員為論文的第一及通訊作者,許建研究者為一同通訊作者。文章內容連接網(wǎng)站地址:https://authors.elsevier.com/sd/article/S0044-8486(21)01175-3.
嗜水汽單胞菌是鯉魚(yú)養殖中傷害最明顯的病原菌之一??茖W(xué)研究員工對傳染源和抵抗的鯽魚(yú)開(kāi)展全基因重轉錄組測序并進(jìn)行全基因相關(guān)性分析,精準定位到八個(gè)與抗病性特性明顯關(guān)系的SNP結構域(圖1),并進(jìn)一步尋找6個(gè)潛在性重要遺傳基因,均為免疫力有關(guān)遺傳基因:rab26,dcc,trim71,ptpn21,muc5b,trim25。八個(gè)明顯關(guān)系的SNP中,有一個(gè)為非同義詞SNP,坐落于遺傳基因trim25的外顯子地區,可引起Trim25蛋白質(zhì)二級結構的更改(圖2),且該遺傳基因在經(jīng)嗜水汽單胞菌感柒后的鯽魚(yú)肝臟中明顯上漲表述??茖W(xué)研究結果顯示鯉在基因水準上的遺傳性差別影響了其抵御細菌感染的功能高低,為全基因培育鯉抗病性新品種給予了必不可少的分子結構基本。
圖1. Manhattan 結果展現圖
圖2. Trim25 蛋白質(zhì)二級結構預測分析
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