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重組漆酶降解黃曲霉毒素B1分子對接分析及產(chǎn)物結構解析(二)

來(lái)源:鄭州天順食品添加劑有限公司 發(fā)布時(shí)間:2021-09-12 09:22:17 關(guān)注: 0 次
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酶魅力對AFs溶解率的危害:將酶魅力各自為1、2、3、4U和5U的漆酶各自與10μL0.1mg/mL的AFB1標液渦流震蕩攪拌,30℃、200r/min孵育12h。對照實(shí)驗為添加同樣大小的pH5.7的0.1mol/L的PBS1別的情況同樣。全部試驗反復3次,溶解率按式(1)測算:

(8)AFs的獲取

將孵育時(shí)間對AFs溶解率的危害:將酶魅力為3U的漆酶與10μL0.1mg/mL的AFB1標液渦流震蕩攪拌,放置30℃、200r/min各自孵育12、24、36、48h和60h。對照實(shí)驗為添加同樣大小的pH5.7的0.1mol/L的硫酸銨緩存溶液(phosphatebuffersaline,PBS),別的情況同樣。孵育溫度對AFs溶解率的危害:將酶魅力為3U的漆酶與10μL0.1mg/mL的AFB1標液渦流震蕩攪拌,各自放置25、30、35、40℃和45℃氣溫下,200r/min孵育12h。對照實(shí)驗為添加同樣大小的pH5.7的0.1mol/L的PBS,別的情況同樣。酶魅力對AFs溶解率的危害:將酶魅力各自為1、2、3、4U和5U的漆酶各自與10μL0.1mg/mL的AFB1標液渦流震蕩攪拌,30℃、200r/min孵育12h。對照實(shí)驗為添加同樣大小的pH5.7的0.1mol/L的PBS1別的情況同樣。解決的試品12000r/min離心式30s,使壁厚上的發(fā)酵物離心式至管底端,并轉換至10mL的具塞玻璃試管中,向玻璃試管中添加等大小的三氯甲烷(在陰涼處開(kāi)展),渦流震蕩10min使其完全攪拌,隨后倒進(jìn)離心管架中,靜放30min分層次,取頂層液態(tài)于玻璃試管中,添加等容積三氯甲烷,汲取下一層有機相發(fā)酵液于離心管架中,同樣實(shí)際操作反復3次。合拼3次有機相于氮鍋爐吹管中,于45℃N2烘干。再用甲醇溶液融解出AFs,并且用0.22μm濾紙過(guò)慮。

(9)HPLC-MS/MS檢驗AFs及標曲的制作

配置的內毒素標液和提煉的內毒素水溶液均用0.22μm濾紙過(guò)慮至高效液相瓶子中。

HPLC標準:高效液相控制模塊為安捷倫1260Infinity:Inertsil0DS-3C18色譜柱(150mmX4.6mm,3μm);流動(dòng)速度0.2mL/min;進(jìn)樣量5μL;流動(dòng)性相A為0.1%苯甲酸水溶液,流動(dòng)性相B為工業(yè)甲醇-水(3:7,V/V);剖析時(shí)間30min;檢驗溫度30℃。

MS/MS標準:電噴霧器離子源:檢測方式:多反映檢測;離子源溫度300℃:錐孔工作電壓15psi;撞擊工作電壓135V;撞擊動(dòng)能30eV:毛細血管工作電壓4kV;品質(zhì)掃描儀范疇m/z313.0~285.0。

(10)響應面試驗設計

在單要素實(shí)驗基本上,以孵育時(shí)間、孵育溫度和酶魅力做為調查要素,以AFB1溶解率是響應值,響應面試驗設計要素與水準如表1所顯示。

(11)AFB1溶解物質(zhì)的測量及構造分析

HPLC標準:ZORBAX-SBC18色譜柱(100mmX2.1mm,3.5μm)。流動(dòng)性相A為0.1%苯甲酸水溶液,流動(dòng)性相B為0.1%苯甲酸工業(yè)甲醇水溶液。梯度方向過(guò)柱程序流程:40%B,6min;60%B,保持16min;100%B,8min;一共運作30min。進(jìn)樣量5μL,流動(dòng)速度0.4mL/min,柱溫箱30℃。

MS標準:做霧化氣GS1工作壓力50psi;做霧化氣GS2工作壓力50psi;氣簾氣工作壓力35psi;離子源溫度550℃:離子源,工作電壓5500V;一級掃描儀去簇工作電壓100V;對焦工作電壓10V;品質(zhì)掃描儀范疇m/z100~1500;二級掃描儀選用TOFMS-Productlon-IDA方式收集質(zhì)譜分析數據信息,誘發(fā)撞擊解離能量分別為20、40V和60V,氣相前,用隔膜泵做品質(zhì)軸校準,使品質(zhì)軸偏差低于0.002%。

二、結果與剖析

1、漆酶的同宗模建結果

在本試驗常用漆酶分子結構未被分析的情形下,運用一些已經(jīng)知道漆酶分子結構的根基上同宗模建能夠,較大的程度上獲得理想的目地蛋白質(zhì)三維構造。運用ChemBioDraw2014手機軟件及其MOEv2014.0901手機軟件制作并轉化成三維構造,如圖所示1所顯示??茖W(xué)研究AFs與該酶的融合方式第一步必須 搭建同宗實(shí)體模型,結果如表2和圖2所顯示。圖三分析表明,99%的漆酶殘基坐落于蛋白質(zhì)構像的有效地區,這說(shuō)明本試驗搭建的漆酶同宗實(shí)體模型合乎立體化學(xué)標準,具備合理化。

2、漆酶與AFB1的相互影響剖析

選用分子對接方式科學(xué)研究AFB1與栓菌漆酶表層的相互影響,致力于剖析AFB1與漆酶相互影響方式。為確立漆酶和內毒素的融合方式,選用誘發(fā)切合的對策,依據配位的構像主鏈蛋白激酶袋子容許挪動(dòng)融入,將內毒素各自對收到漆酶的活性位置,獲得漆酶魅力結構域與配位的融合方式,如圖4所顯示,連接打分成-6.4532kca/mol。
 

依據所建立的連接實(shí)體模型,如圖4所顯示,AFB1叔丁基的氧分子可做為共價(jià)鍵的蛋白激酶,與漆酶上一個(gè)高寬比傳統與此同時(shí)也挨近碘離子(T1CuI)部位的His481上碳水化合物主鏈產(chǎn)生共價(jià)鍵,此外,AFB1咪唑環(huán)上的氧分子還可以做為共價(jià)鍵的蛋白激酶,與漆酶Asn288的主鏈產(chǎn)生共價(jià)鍵,因而,His481和Asn288是漆酶和AFB1融合時(shí)的重要碳水化合物結構域,根據共價(jià)鍵相互影響。

酶-配位的融合感染力與其說(shuō)相互影響的速率相關(guān),遭受配位的結構類(lèi)型和歪曲水平及其配位和酶表層中間樣子相輔相成的危害。有研究表明共價(jià)鍵是酶與配位相互影響的重要相互作用力,參加共價(jià)鍵產(chǎn)生的氨基酸殘基被覺(jué)得是漆酶與小分子水配位相互影響的重要殘基。在其中氧分子與氨基酸殘基產(chǎn)生的氫鍵作用強過(guò)氧原子與氨基酸殘基產(chǎn)生的共價(jià)鍵,且共價(jià)鍵鍵長(cháng)越少,功效越強。連接仿真模擬研究表明,存有于T1銅孤電子對層中的單純的殘基His481最很有可能與AFs產(chǎn)生相互影響,產(chǎn)生共價(jià)鍵,推斷其能夠受體空氣氧化全過(guò)程中的電子轉移,提升 電子傳遞高效率,進(jìn)而提升 漆酶催化反應工作能力。綜合性各個(gè)方面因素導致酶對內毒素的功能工作能力存有差別,主要表現為連接成績(jì)不一樣。

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