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茵陳質(zhì)量標志物的預測(二)

來(lái)源:鄭州天順食品添加劑有限公司 發(fā)布時(shí)間:2021-09-17 15:25:04 關(guān)注: 0 次
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2.1.3 GO歸類(lèi)聚集剖析

將所取得的8一個(gè)靶標導進(jìn)STRING數據庫查詢(xún)開(kāi)展GO作用聚集剖析,獲得GO內容1 89兩個(gè),在其中微生物全過(guò)程內容1 64八個(gè),細胞組成內容8兩個(gè),分子結構作用內容16兩個(gè),各自占73%、13%、14%.在其中,微生物全過(guò)程關(guān)鍵涉及到碳氫化合物新陳代謝全過(guò)程的正管控、生物大分子新陳代謝全過(guò)程的正管控、體細胞全過(guò)程的正管控、刺激性反映的調整、體細胞對有機化學(xué)成分的反映、體細胞對有機化學(xué)刺激性的化學(xué)反應及對含氧量化學(xué)物質(zhì)的反映等全過(guò)程;分子結構作用關(guān)鍵涉及到激話(huà)轉錄因子融合、蛋白融合、酶融合及蛋白異構化活力等作用;細胞組成涉及到在膜融合體細胞器、細胞核部、胞外區及細胞結構等地區.3個(gè)支系總數排名前20位有關(guān)內容信息內容柱形圖如圖2所顯示.

2.1.4 KEGG通道聚集剖析

運用DAVID6.8.0數據庫查詢(xún)對8一個(gè)靶標開(kāi)展通道聚集剖析,獲得281條轉錄因子(P<0.05),涉及到癌病、乙肝和TNF轉錄因子等,說(shuō)明這種靶標很有可能關(guān)鍵根據管控這種通道做到干涉病癥的目地.前20位轉錄因子氣泡圖如圖所示3所顯示.

2.1.5“成份—靶標—通道”互聯(lián)網(wǎng)搭建及剖析

將聚集剖析獲得的排名前20的通道所相對應的5七個(gè)功效靶標及13種成份,應用Cytoscape3.7.1手機軟件搭建“成份—靶標—通道”互聯(lián)網(wǎng),依據網(wǎng)上的拓撲學(xué)特性度值排列明確關(guān)鍵節點(diǎn),在所建立的互聯(lián)網(wǎng)中,根據Degree值(度值)明確關(guān)鍵節點(diǎn),度值>中位值(成示值中位值=3,靶標度值中位值=15,通道度值中位值=14)的成份有4種,靶標有2八個(gè),通道有10條.4種成份為原兒茶醛、異鼠李素、β-谷甾醇及茵陳蒿靈A,度值各自為55、8、7和5,因為該4種化學(xué)物質(zhì)在網(wǎng)上中有著(zhù)較高的連結度,提醒這可能是茵陳充分發(fā)揮藥力的關(guān)鍵活力成份.靶標的關(guān)鍵節點(diǎn)分別是AKT1、TNF、JUN、MAPK1、RELA、TP53及IL6,度值分別是38、37、37、36、36、34及31,說(shuō)明這可能是茵陳化學(xué)物質(zhì)功效于癌病、惡性腫瘤、乙肝病毒與病毒感染等轉錄因子潛在性的主導作用靶標.網(wǎng)絡(luò )藥理學(xué)科學(xué)研究從成份實(shí)效性視角提醒原兒茶醛、異鼠李素、β-谷甾醇及茵陳蒿靈A等成份可做為茵陳潛在性Q-marker開(kāi)展多方面科學(xué)研究.

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